El Patronato de la Fundación, integrado por representantes de la Administración, de los mecenas y de los colectivos de víctimas del terrorismo, acordó, en julio de 2005, el nombramiento de Maite Pagazaurtundúa Ruiz como presidenta ejecutiva de la Fundación, tras la dimisión presentada, por motivos personales, de Ana María Vidal Abarca. Adolfo Suárez es el Presidente de Honor y María Jesús González continúa ocupando la
vicepresidencia de la Fundación.